DB관련 질문은 아닌듯 하네요...^^;

우선 PHP에서 MS-SQL에 접속 가능 합니다.

IIS에서 PHP모듈 붙여서 돌릴수 있다고 합니다. Apache에 PHP 붙이듯 하면 됩니다.

IIS랑 Apache랑 같이 돌릴 수는 있으나 어느 한쪽의 Port를 변경 해주어야 합니다.

제가 보기에 님 회사의 서버는 ASP에 MS-SQL이고 타 회사 서버는 PHP의 mysql인것 같군요. 프로세스는 타 회사에서 로그인시 님 회사의 DB를 경유해야 하는것 같군요.

그런데 위와 같이 작업할때 타 회사의 PHP에서 님 회사의 MS-SQL에 접속할때 계정과 비밀번호가 타 회사에게 누출 되어 좋지가 않습니다.

가장 좋은 방법은 타사의 DB를 접근하지 않아도 되도록 만드셔야 합니다.

타사 로그인 액션 페이지에서 님의 회사에서 가져갈 정보를 넘기는 페이지로 전환 후 다시 타사에 넘기는 데이터를 받는 페이지로 페이지 전환을 하면 됩니다.

로그인(타사) -> 정보를 넘기는 페이지(님) -> 넘겨 받은 후 페이지(타사)