php 스쿨에서 관리툴에 대한 자료가 있어서 여기 옮겨봅니다.
http://www.phpschool.com/bbs2/inc_view.html?id=743&code=down2
제품 회사 사이트
http://www.mysqlstudio.com/
공개용으로 MySql Front 라는 프로그램도 많이 언급을 하고 있군요. 개인적으로는 gui를 잘 사용하는 편은 아니지만 한번 살펴보면 재미있을듯.