안녕하세요 박성원입니다. 

훗~ 방금 글적었는데 취소하고 다시씁니다. 

아무래도 max_connection 문제이거나 세션(스레드)의 과도한 증가 인듯하네요 ^^;

우선 php 문서나 C/S툴에서 작성하신 구문중에 새롭게 connection을 하시고 close하는 부분이 잇는지 확인해보시고 close를 해주는 부분이 없다면 확인 후 해주셔야됩니다. 

mysql의 환경설정 중 대기 시간을 잡아주는게 있는데 이걸 디폴트로 쓰셨을경우 상당히 오랜시간동안 기다리기때문에 connection 개수를 초과하여서 발생할 수 있습니다. 

그래서.. connection 자체를 늘려주는 부분이 있습니다. 

우선 

show variables like 'max_connections' 하셔서 리턴되는 값을 보시고 그값보다 크게 환경설정을 해주시면됩니다. 대략 서비스에 접속하는 커넥션이 얼마인지 확인해보시구요 거기에 대비해서 계산해주는것이 좋지요. 이문제는 이 커뮤니티에서 조사하면 금방 나올꺼구요

환경설정 파일에서 

max_connections = 1000

이런석으로 설정해 주시면 될것 같습니다. 

만약 첫음 제시했던 문제가 그대로 있을경우, 스레드의 과도한 증가는 여전히 문제점으로 발생할 듯합니다. 다만 그 기간이 현재보다 조금 더 연장될 뿐이지요. 우선 그부분부터 확인하시는게 급선무 인듯합니다.