alter database 명령으로 데이터베이스의 인코딩을 바꿀 수는 없습니다. 

윗 작업을 하려면, 

euc-jp 데이터베이스를 하나 만들고, 

euc-kr 모든 스키마와 자료를 덤프해서, 

그 덤프파일의 인코딩을 euc-jp로 바꾸고, 

euc-jp 데이터베이스에 리스토어 하고, 

기존 데이터베이스의 이름을 바꾸어 놓거나, 삭제하고, 

새 데이터베이스의 이름을 기존 이름으로 바꾸면 되겠죠. 

잘 될지는 모르겠지만, 

일단 모든 자료를 덤프 받아서 

iconv 툴로 euc-jp로 바꾸고 데이터베이스를 euc-jp로 만들어 리스토어 하면 될 것 같네요. 

문제의 핵심은 euc-kr 쪽으로 자료가 담길 때, 일본에만 있고 한국어에는 없는 글자들이 

어떻게 저장되었냐인데, 

7.2.x 버전 이상인데, 아무 문제 없이 잘 쓰고 있었다면, 아마도 

html escaping 문자로 일본어 고유 문자들이 저장되었을 것 같네요. 

예를 들을어서 %20%30... 이런 식으로 말이죠.

이런 내용들에 대해서는 iconv 툴로도 변환될 수 없을 것 같습니다. 

감사합니다.