답글 감사드립니다.
하지만 제 질문은 그게 아니었습니다. ToT
당연히 메시지옵션은 줬구요. 메시지옵션줘서 나오는 파일이 만들어지긴 합니다.
문제는 그 파일이 만들어지는 시점입니다.
배치파일 수행이 끝나면 그 파일이 만들어져 있을거고, 그 파일을 읽어서 다른 로그파일이 넣어주는건데요.
그 파일을 읽어서 다른 로그파일에 넣어주는 그 시점에 그 파일이 없다는 이야기입니다.
자바 내부에서 분명 프로세스 종료 체크하고 있기 때문에 끝났으면 그 메시지옵션으로 지정한 파일이 있어야 하는데 없습니다. 하지만 자바 파일이 다 끝나고 보면 있습니다. 
컴퓨터성능의 문제인지 될 때도 있고 안될때도 있네요.
머가 문제인지 모르겠습니다.