1. 전체 count를 비교해보세요
   import나 load를 사용하셨다면 informix에서 조회된 순서대로 데이터가 들어갑니다. 
   count가 같다면 동일하다고 보셔도 될것 같은데요. 
2. 전체 count가 다르다면 특정 조건으로 나누어서 count를 해서 틀린 부분을 찾아 보세요. 
   select substr(yymmdd,1,6), count(*) 
      from t1
    where yymmdd like '2007%' 
   group by substr(yymmdd,1,6)
    이런 식으로 범위를 줄여가면서 찾아야 할 것 같습니다. 
3. 맨 끝에 들어간 데이터를 찾으시려면 index를 사용하지 않고 모든 데이터를 조회하는 방법만 있을거 같은데요. 
    마지막에 입력된 데이터를 기준으로 하는 것보다 informix에서 가장 마지막에 들어간 데이터가 db2 에도 들어가 있는지 확인하는게 더 나을것 같습니다.

select * from aaa order by ??? desc first 1 row only

???  <== 정렬하고픈 컬럼